Родился 9 марта 1973 года в Саратове, в семье оперного певца Джонрида Аршавировича Оганесяна и пианистки. По национальности — армянин.
Некоторые источники приводят информацию о том, что Иван Оганесян окончил среднюю специальную музыкальную школу при Белорусской государственной консерватории по классу виолончели. Журнал «7 дней», опубликовавший интервью с Иваном Оганесяном, даёт такие сведения: «Знакомые рассказали, что талантливые педагоги есть в Минске. Там, при музыкальной школе имелся интернат для одарённых детей из других городов, куда Иван … и переехал. Пару лет спустя он опять сменил город: поступил в ЦМШ при Московской консерватории». Сам Иван Оганесян в другом интервью об это сказал так: «В четырнадцать лет я уехал в Минск. Почему-то именно этот город возник в голове моей мамы — там жили то ли родственники, то ли знакомые, от которых она узнала, что в белорусской столице есть потрясающий педагог. И я отправился к нему поступать. Жил в интернате, учился, играл, даже подавал надежды, но… Не складывалось у меня что-то с учёбой. Если бы занимался прилежнее, наверное, стал бы неплохим виолончелистом. В 1989 году я приехал в Москву и поступил в ЦМШ при Московской консерватории».
Учился на музыкальном факультете РАТИ (ГИТИС), куда был зачислен сразу на второй курс.
В 1997 году поступил в актёрскую мастерскую Петра Наумовича Фоменко режиссёрского факультета РАТИ-ГИТИС, но не окончил её. Сам Иван говорил об этом так: «… Потом в моей жизни произошёл очередной зигзаг. В Москву приехали агенты из израильского театра „Гешер“. Я прошёл кастинг, бросил учёбу у Фоменко, ушёл от Виктюка и поехал в Израиль. Через неделю вернулся — долгая история и неинтересная, всё дело в документах. Суть в другом — я вернулся, а мосты-то все сожжёны…».
Участвовал в московском мюзикле «Норд-Ост». 23 октября 2002 года, во время теракта на Дубровке, Иван находился на сцене (в здании Дома культуры ОАО «Московский подшипник», расположенном в доме № 7 на улице Мельникова в Москве), играл в этом мюзикле лётчика, и, в числе всех присутствующих там артистов и зрителей, был захвачен террористами в заложники, трое суток удерживался ими и был освобождён в результате проведённой операции по освобождению заложников. Его старшей дочери Олесе тогда, 24 октября 2002 года, исполнился один год.
